Pondok Pesantren Darul Hikam Mangli Kaliwates Jember didirikan pada tahun 2015 dengan tujuan untuk tafaquh fid din terutama bagi mahasiswa IAIN Jember yang hendak melakukan pendalaman terhadap khazanah kitab kuning. 

Pada saat itu, para santri ada yang mukim dan ada pula yang tidak, hal ini dikarenakan keterbatasan tempat bagi santri yang ingin mukim di Darul Hikam. Pondok Pesantren Darul Hikam berpusat di Perum Milenia Blok C.7 No. 6 Mangli Kaliwates Jember. Hampir semua santri yang bergabung adalah para mahasiswa IAIN Jember (Sekarang UIN). Kurang lebih terdapat 30-50 santri pada awal mula pondok pesantren Darul Hikam didirikan. Para santripun masih hanya terbatas dari kalangan perempuan saja.

Dengan penuh kesederhanaan, Pondok Pesantren Darul Hikam mengkaji banyak kitab kuning yang menunjang kebutuhan mahasiswa di IAIN Jember kala itu. Para ustad dan ustadzah merupakan tenaga pengajar yang memiliki kedalaman ilmu yang matang di bidang kitab kuning.

Namun demikian, Pondok Pesantren Darul Hikam Mangli Kaliwates Jember tidak hanya mencukupkan dengan kajian kitab kuning, melainkan dengan kajian modern dengan teori-teori modern yang digunakan pisau analisa oleh santri yang umumnya mahasiswa tersebut.

Tingginya permintaan dari masyarakat sekitar khususnya warga Kelurahan Mangli, Kecamatan Kaliwates, Kabupaten Jember agar terdapat lembaga keagamaan bagi para penerus generasi bangsa khususnya para mahasiswa, pengasuh dan segenap pengurus pondok pesantren berinisiatif untuk mengembangkan Darul Hikam lebih baik lagi. 

Hasilnya, pada tahun 2022, para santri bersama alumni yang pernah belajar di Pondok Pesantren Darul Hikam  mencapai kurang lebih 500 santri. Bahkan, di tahun ini pula, secara resmi Pondok Pesantren Darul Hikam membuka mahasanti baru untuk putra yang berlokasi di Kecamatan Ajung.

Pondok Pesantren Darul Hikam Mangli Kaliwates Jember memiliki tiga tempat sebagai tempat kegiatan belajar mengajar, yaitu pondok pusat putri, pondok cabang putri dan pondok cabang putra.